SPM2 oder SPM99
*SPM2 und SPM99 i.d.R. nicht kompatibel!
*SPM2 läuft inzwischen stabil
*SPM2 wesentlich langsamer als SPM99, insbesondere mit älterem Matlab (5.x)
*SPM2 Ergebnisse nicht viel besser
*Scripting unter SPM2 einfacher
*Reviewer verlangen inzwischen SPM2
*Manche Tools arbeiten nur mit SPM99, nur wenige mit SPM2